ทับทิมเป็นส่วนหนึ่งของตระกูล Punicaceae และสกุลPunicaโดยมีสองสายพันธุ์ Punica granatumและPunica protopunica ชนิดหลังเป็นโรคเฉพาะถิ่นของเกาะ Socotra (เยเมน) และถือว่ามีบทบาทสำคัญในการพัฒนารูปแบบทับทิมที่ได้รับการเพาะปลูก เนื่องจากถือว่าเป็นบรรพบุรุษของสกุลPunica [ 5 ] สกุลPunicaมีลักษณะเฉพาะที่จัดอยู่ในลำดับ Myrtales แม้ว่าวงศ์ที่ควรจะเป็นที่ถกเถียงกันก็ตาม [ 5 ] ในอดีต เนื่องจากมีการศึกษาทางสัณฐานวิทยาในช่วงต้น   ประโยชน์ของทับทิม  จึงเชื่อกันว่า สกุล Punicaควรได้รับการพิจารณาภายใต้วงศ์ Lythraceae [2 ] แต่มีข้อถกเถียงมากมายเกี่ยวกับการจำแนกออกเป็นครอบครัว อย่างไรก็ตาม เนื่องจากลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่เป็นเอกลักษณ์และคุณสมบัติอื่นๆ เช่น ผลไม้ที่มีเปลือกหุ้มหนัง เมล็ดเป็นเนื้อมีซาร์โคเทสตาที่กินได้ ไข่ที่มีจำนวนเต็มด้านนอกหลายชั้น และอาร์เคสโพเรียมที่มีเซลล์เดียว ทับทิมจึงพบว่าแตกต่างจากจำพวก Lythraceae ทั่วไปและมี จึงถูกรวมอยู่ในวงศ์แยก Punicaceae